機構?教育研究施設等

研究所

発生医学研究所	産業ナノマテリアル研究所

病院

ヒトレトロウイルス学共同研究センター

附属図書館

機構

大学院先導機構	熊本創生推進機構
グローバル推進機構	大学教育統括管理運営機構
国際先端医学研究機構	国際先端科学技術研究機構
半導体?デジタル研究教育機構 附属情報統括センター 教授システム学教育実践力開発拠点

学内共同教育研究施設等

永青文庫研究センター	五高記念館
くまもと水循環?減災研究教育センター	先進マグネシウム国際研究センター
生命資源研究?支援センター	環境安全センター
埋蔵文化財調査センター

保健センター

文書館